无公害食品茶叶标准的科学性主要表现在标准的结构设置合理和内容科学完整等方面，重点突出解决茶叶质量安全问题。
标准根据茶叶生产实际情况，将产地环境、生产过程、加工过程和产品质量分别制定成四个标准，构成完整的无公害食品茶叶生产技术体系，克服了以往茶叶标准只重视“终端产品质量”，忽视“生产过程”之不足，真正体现了从“从土地到茶杯”的全过程质量控制。在产地环境条件要求上，标准内容的重点放在对产地空气、土壤和灌溉水质量的要求，尤其是根据茶树的生理特点，对茶园土壤和灌溉用水的PH值、重金属元素含量水平要求较高。在生产过程方面，标准内容的重点放在茶树病虫害的综合防治技术、茶园施肥和用药安全上，并以表格的形式列清楚茶树主要病虫害的名称、防治指标、用药品种、用药剂量和安全间隔期，简单明了，非常便于茶农使用。在加工过程方面，标准内容的重点放在茶厂卫生、机械设备卫生和茶叶加工人员的卫生与健康上，而对具体的茶叶加工工艺不作统一要求，这样既保证的茶叶的卫生质量，又便于茶叶加工工艺的创新。在茶叶产品质量上，标准内容的重点也是放在解决茶叶有突出问题的农药残留、有毒有害元素、大肠菌群和灰分的污染方面，而对茶叶的感官品质只作基本要求，这样既保证了茶叶的质量安全，又可充分发挥不同品类茶叶的品质风格特征。
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